南京理工大學(xué)于2010年7月以現(xiàn)有環(huán)境科學(xué)與工程、生物化工、輻射防護(hù)及環(huán)境保護(hù)等學(xué)科和生物工程、環(huán)境工程、輻射防護(hù)與環(huán)境工程三個(gè)專(zhuān)業(yè)為基礎(chǔ)，新組建了環(huán)境與生物工程學(xué)院。
環(huán)境工程專(zhuān)業(yè)成立于1979年，環(huán)境監(jiān)測(cè)專(zhuān)業(yè)成立于1983年，均是江蘇省成立最早，也是國(guó)內(nèi)同類(lèi)院校中較早招生的環(huán)境類(lèi)專(zhuān)業(yè)。1998年，根據(jù)教育部學(xué)科專(zhuān)業(yè)調(diào)整要求，環(huán)境工程專(zhuān)業(yè)與環(huán)境監(jiān)測(cè)專(zhuān)業(yè)合并，成立了新的環(huán)境工程專(zhuān)業(yè)，并獲評(píng)國(guó)防科工委重點(diǎn)學(xué)科，江蘇省特色專(zhuān)業(yè);生物工程專(zhuān)業(yè)成立于1994年，是“211”工程重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科;輻射防護(hù)與環(huán)境工程專(zhuān)業(yè)成立于2007年，是國(guó)防科工委緊缺專(zhuān)業(yè)、國(guó)防特色專(zhuān)業(yè)。
學(xué)院擁有省部級(jí)重點(diǎn)學(xué)科1個(gè)，省部級(jí)特色專(zhuān)業(yè)1個(gè)，國(guó)防科工委緊缺專(zhuān)業(yè)1個(gè)。建有國(guó)家推廣中心1個(gè)，教育部工程中心1個(gè)，江蘇省技術(shù)中心1個(gè)，江蘇省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)。開(kāi)設(shè)3個(gè)本科專(zhuān)業(yè)，擁有2個(gè)博士點(diǎn)、4個(gè)碩士點(diǎn)、2個(gè)工程碩士領(lǐng)域。
根據(jù)國(guó)內(nèi)外環(huán)境和生物工程相關(guān)專(zhuān)業(yè)發(fā)展趨勢(shì)，逐步形成了水污染控制理論與工程、大氣污染控制技術(shù)與工程、固體廢棄物處理與處置技術(shù)、環(huán)境監(jiān)測(cè)理論與技術(shù)、膜分離理論與技術(shù)、環(huán)境生物材料、基因工程與生物物質(zhì)分離提取，生物化學(xué)與酶工程，資源微生物開(kāi)發(fā)和利用、輻射防護(hù)與環(huán)境工程等多個(gè)研究方向。
學(xué)院已建立起高水平的由名譽(yù)院長(zhǎng)唐孝炎院士領(lǐng)銜的學(xué)術(shù)隊(duì)伍近50人，其中高級(jí)職稱(chēng)29人，教師和科研人員中擁有博士學(xué)位的比例達(dá)到75%，具有海外留學(xué)背景的超過(guò)60%，形成了結(jié)構(gòu)優(yōu)化、團(tuán)結(jié)協(xié)作、富有創(chuàng)新的團(tuán)隊(duì)。一些中青年教師已迅速成長(zhǎng)為國(guó)內(nèi)有一定影響的學(xué)科帶頭人，多人分別獲得“中國(guó)青年科技獎(jiǎng)”、“全國(guó)環(huán)保杰出貢獻(xiàn)者”、“新世紀(jì)百千萬(wàn)人才工程”國(guó)家級(jí)人選、“霍英東教育基金”、“江蘇青年科技獎(jiǎng)”和“省部級(jí)有突出貢獻(xiàn)中青年專(zhuān)家”等獎(jiǎng)勵(lì)。
近年來(lái)，學(xué)院先后承擔(dān)了國(guó)家863、973、國(guó)家自然科學(xué)基金、國(guó)防軍工等一批重點(diǎn)重大項(xiàng)目，科研經(jīng)費(fèi)逐年上升。發(fā)表學(xué)術(shù)論文1000余篇。先后獲得包括國(guó)家科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)、省部級(jí)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)等在內(nèi)的各類(lèi)國(guó)家、省部級(jí)科技成果獎(jiǎng)30多項(xiàng);同時(shí)，學(xué)院還積極與大型企業(yè)合作，完成許多產(chǎn)學(xué)研及環(huán)保合作項(xiàng)目，解決了圍繞企業(yè)的環(huán)保技術(shù)難題，在國(guó)內(nèi)外具有較高的知名度和影響力。
學(xué)院十分注重國(guó)內(nèi)外的學(xué)術(shù)交流和合作。與美國(guó)、加拿大、澳大利亞、法國(guó)、瑞典、日本等國(guó)及港臺(tái)地區(qū)的高校和科研機(jī)構(gòu)建立了長(zhǎng)期的合作關(guān)系。每年派出多名訪問(wèn)學(xué)者、交流學(xué)者、研究生到國(guó)外知名高校學(xué)習(xí)交流，有效提升了學(xué)院的自主創(chuàng)新能力和科技競(jìng)爭(zhēng)力。