廈門大學環(huán)境與生態(tài)學院于2011年3月30日成立，是在原海洋與環(huán)境學院的環(huán)境學科和生命科學學院的生態(tài)學科基礎上重新組建。學院下設環(huán)境科學、生態(tài)學、環(huán)境與生態(tài)工程、環(huán)境科學研究中心四個系（中心）。擁有環(huán)境科學與工程、生態(tài)學兩個一級學科博士點和博士后流動站，環(huán)境科學國家重點學科，生態(tài)學和環(huán)境工程省級重點學科。

　　本學科群擁有1個國家級科研平臺（和海洋與地球?qū)W院共建：近海海洋環(huán)境科學國家重點實驗室），3個省部級科研平臺（濱海濕地生態(tài)系統(tǒng)教育部重點實驗室、福建省海陸界面生態(tài)環(huán)境重點實驗室、福建省濱海濕地保護與生態(tài)恢復工程技術(shù)研究中心），以及1個校級多學科交叉研究平臺（海洋與海岸帶發(fā)展研究院），并擁有國家環(huán)保部頒發(fā)的甲級環(huán)境影響評價證書。

　　學院瞄準全球變化和人類活動等多重壓力下近海－流域與濕地生態(tài)系統(tǒng)演變機制的重大科學前沿，同時針對國家與地方對近海－流域－濕地生態(tài)安全和防災減災的重大需求。本學科群（環(huán)境與生態(tài)學科）將以亞熱帶水域生態(tài)系統(tǒng)(流域－河口－近海)和濱海濕地生態(tài)系統(tǒng)為主要研究對象，主攻水域和濕地生態(tài)系統(tǒng)與環(huán)境演變過程與機理及其生態(tài)環(huán)境效應，建立生態(tài)系統(tǒng)水平的海陸統(tǒng)籌管理的理論體系，同時大力發(fā)展環(huán)境工程、生態(tài)工程和環(huán)境評價等相關(guān)應用類學科的發(fā)展。

　　2012年9月，學院即將搬遷至翔安校區(qū)，新校區(qū)內(nèi)建有占地面積為2萬平方米的環(huán)境與生態(tài)學院大樓，為學院的發(fā)展提供新的契機和更廣闊的空間。