沈陽藥科大學從1956年起招收研究生，是國務(wù)院學位委員會首批授權(quán)具有授予博士、碩士學位，較早開展在職人員以研究生同等學力申請碩士學位，自行審定博士生指導(dǎo)教師的單位。具有藥學一級學科博士學位授予權(quán)，碩士招生專業(yè)26個：藥物化學，藥劑學，生藥學，藥物分析學，微生物與生化藥學，藥理學，企業(yè)管理學，藥事管理學，天然藥物化學，臨床藥學，中藥化學，中藥生物技術(shù)學，中藥藥理學，中藥藥劑學，中藥鑒定學，中藥分析學，中藥炮制學，中藥資源學，生物化學，應(yīng)用化學,分析化學，有機化學，生物化學與分子生物學，中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)，藥物信息學，制藥工程。博士招生專業(yè)19個，藥物化學，藥劑學，生藥學，藥物分析學，微生物與生化藥學，藥理學，藥事管理學，天然藥物化學，臨床藥學，中藥化學，中藥生物技術(shù)，中藥藥理學，中藥藥劑學，中藥鑒定學，中藥分析學，中國炮制學，中藥資源學，藥物信息學，制藥工程。藥劑學是國家重點學科，藥物化學，藥物分析學是省級重點學科。學校設(shè)有一級學科藥學博士后流動站。1996年經(jīng)教育部批準，建設(shè)國家理科基礎(chǔ)科學研究和教學人才培養(yǎng)基地（醫(yī)藥學），1997年開始招收本、碩、博連讀學生。2002年經(jīng)教育部和國家發(fā)展計劃委員會批準，建立國家生命科學與技術(shù)人才培養(yǎng)基地，學制6年。
學校2007年招收碩士研究生440名，博士研究生107名，研究生課程進修班學員近100名，在校各類研究生2000余人（統(tǒng)計時間，2004年9月）。已培養(yǎng)研究生1400余名，為社會培養(yǎng)一批優(yōu)秀藥學人才，其中有4名畢業(yè)研究生獲得了國家杰出青年科學基金。81級碩士研究生裴鋼當選為中國科學院院士。眾多畢業(yè)生成為知名學者、企業(yè)家、政府官員。
學校擁有眾多著名專家、學者，有中國工程院院士1名，教授、副教授200余名，一批在科研及教學工作中卓有成效的中青年教師充實了研究生導(dǎo)師隊伍，其中博士生指導(dǎo)教師近60名，碩士生指導(dǎo)教師150余名。
學校積極開展國內(nèi)外學術(shù)交流，與美國加利福尼亞大學藥學院、明尼蘇達大學藥學院、英國利物浦約翰穆爾斯大學藥學院、日本東京大學、名城大學、香港中文大學、臺灣中國醫(yī)藥學院等建立校際關(guān)系，進行廣泛科技合作，對我校研究生培養(yǎng)起到推動作用。
學校在開展學位與研究生教育過程中，始終把培養(yǎng)質(zhì)量放在頭等重要地位，不斷更新教育思想，轉(zhuǎn)變教育觀念，積極探索研究生教育改革，探索實踐、"寬進嚴出"的管理、培養(yǎng)方式，建立提前攻博，與科研單位聯(lián)合培養(yǎng)研究生和聘任外校、科研機構(gòu)兼職研究生導(dǎo)師制度，優(yōu)化培養(yǎng)過程，加強課程體系建設(shè)，強化創(chuàng)新精神和實際能力的培養(yǎng)。學校把優(yōu)先發(fā)展研究生教育作為"十五"期間的工作重點。學校正認真貫徹"立足國內(nèi)，適度發(fā)展，優(yōu)化結(jié)構(gòu)，相對集中，推進改革，提高質(zhì)量"的方針，在不斷加強學科建設(shè)的基礎(chǔ)上，努力將我校建設(shè)成高水平的高層次創(chuàng)造性人才培養(yǎng)基地。
基本數(shù)據(jù)：
博士后流動站 1個
博士專業(yè)：19個
碩士專業(yè)：26個
本科專業(yè)：13個
�？茖�業(yè)：6個
國家級人才基地2個
國家級重點學科1個
國家級試驗中心1個
省級重點學科2個
省部級實驗室2個
國家級優(yōu)秀博士論文：1篇
省級優(yōu)秀博士論文：8篇
SCI論文數(shù)（2006年發(fā)表）：246篇